Ada tiga metode pemrograman peralatan mesin CNC: pemrograman manual, pemrograman otomatis, dan pusat permesinan CAD/CAM.
Pemrograman dengan tangan
Analisis gambar komponen manual, pemrosesan proses, kalkulasi numerik, penulisan daftar program, dan input serta inspeksi program diselesaikan secara manual. Cocok untuk pemesinan titik atau komponen dengan geometri yang kurang kompleks, tetapi sangat memakan waktu dan rentan terhadap kesalahan saat menyusun komponen yang kompleks.
Pemrograman otomatis
Proses penggunaan komputer atau mesin pemrograman untuk menyelesaikan persiapan program komponen sangat praktis untuk komponen yang rumit.
Bahasa Indonesia: CAD/CAM
Perangkat lunak CAD/CAM digunakan untuk mewujudkan pemrograman otomatis pemodelan dan gambar. Perangkat lunak yang paling umum adalah Master CAM, yang dapat menyelesaikan pemrograman milling 2, 3, 4 dan 5, turning, wire EDM, meskipun perangkat lunak semacam ini memiliki satu fungsi, namun mudah dipelajari dan murah.